汉代属西域都护府下辖的捐毒国。
唐属疏勒都督府。
清乾隆二十三年（1758），始属喀什噶尔。
光绪九年（1883）属疏附县管辖。
1913年，设乌鲁克恰提分县。
1929年10月27日，从疏附县析置乌鲁克恰提设治局，治所在今乌鲁克恰提乡政府驻地。
1938年，正式建县，定名乌恰县，县政府驻黑孜苇，隶属喀什行政区。
1954年7月，划归克孜勒苏柯尔克孜自治区。
1955年10月，克孜勒苏柯尔克孜自治区改为克孜勒苏柯尔克孜自治州。
1985月8月23日，发生7.4级强烈地震，老县城被毁。
后在距老县城东边6千米处的博鲁什戈壁滩新建县城。
1989年10月17日县城迁入现址。