宋设清流镇。
清属同化乡。
民国二十一年（1932年），镇改乡。
1950年1月，驻清流场三圣庙。
1958年10月，乡改公社。
1984年2月，公社改乡。
1992年7月，并入共和乡。
1995年10月，更名清流乡。
2001年5月，共和乡析出。
2005年9月，改县直属乡。
2017年4月，经四川省人民政府和资阳市人民政府批复，同意安岳县撤销清流乡，设立清流镇，以原清流乡的行政区域为清流镇的行政区域，清流镇人民政府驻翰林街151号。