西周武王伐纣，建立周朝，为追念先王之恩德，将黄帝后裔分封到祝（现禹城、齐河、长清一带），名曰“祝国”。
后郡称祝柯，春秋时诸侯“盟于祝柯”就在此地，改为祝柯县。
汉高祖五年（前202）改称祝阿县，县址未搬迁。
北魏皇兴三年（469），县址由古城村迁至阿阳城（现禹城火车站杨城子）。
唐祝阿县改名禹城，县址依然。
五代十国时沿唐制。
金时属济南府。
金天会八年（1130），分治齐河县。
元代禹城县属曹州。
明、清时属济南府。
1912年禹城县隶属山东省济南府。
1913年属山东省济西道，次年改属东临道，1925年属德临道，1928年直隶于山东省。
1946年属冀鲁豫第六专区。
1950年隶属德州专区。
1956年改属聊城专区。
1958年12月撤销禹城县，其辖区分布划归高唐、齐河2县。
1961年恢复禹城县建制，复属德州专区。
1993年9月9日，撤销禹城县，以原禹城县的行政区域设立禹城市（县级）。