莘县历史悠久，早在新石器时期，境内已有氏族部落存在。
春秋时为卫国莘邑，战国时地处齐之西界。
秦置阳平县，属东郡。
三国属魏之冀阳平郡。
晋属司州阳平郡。
后北齐改阳平县为乐平县。
北周置武阳郡，又析其地置莘亭县。
隋开皇六年（586）复名阳平县，属武阳郡。
隋开皇十六年（596）设莘县。
唐武德四年（621），置莘州，莘县属之。
另设莘亭县，属博州。
次年，废莘亭县，其地仍归莘县。
唐贞观四年（630）废莘州，复置莘县，属魏州。
宋时莘县属河北东路大名府。
元属中书省东昌路。
明、清两代属山东布政司东昌府。
民国时期，1912年，属山东省东临道。
1928年，废道称山东省莘县。
1936年，属山东省第六督察专员公暑。
1939年，建立抗日民主政府，属鲁西行政委员会。
1941年，属鲁西行政区鲁西北专区（同年11月称第三专区）。
1943年，改属冀南七专署。
1944年，莘县全境解放，成立莘县民主政府。
1948年，属冀南一专署。
1949年，冀南第一专区撤销，莘县改属平原省聊城专区。
1949年，属平原省聊城专区。
1952年，平原省撤销，属山东省聊城专区。
1955年，属山东省聊城地区。
1956年3月，观朝县撤销，朝城、妹冢2个区划归莘县，其余划归范县。
1958年，莘县建置撤销，燕店、王奉2个公社划归冠县，其他划归范县。
1961年，莘县建置恢复，原划为冠县、范县辖区全部归回莘县。
1964年，范县北部的古云、观城、樱桃园、古城、王庄集5个区划归莘县。
此后至今，莘县版图未有变动。
1997年，聊城撤地设市，莘县属聊城市至今。
莘县之名沿用至今。