秦属黔中郡、象郡地。
汉属镡成县地，隶武陵郡。
唐贞观八年（634年），析龙标县地设朗溪县，为会同县境内置县之始，隶巫州，后隶叙州。
五代时，县废，为诚州地。
宋崇宁元年（1102年）设三江县，1103年改为会同县，诚州改为靖州，会同县属靖州。
1914年，靖州废，改属辰沅道。
1922年，直属湖南省。
1936年至1949年9月，先后属湖南省第四、第七、第十行政督察区。
1949年10月设会同专区，同年11月1日成立县人民政府，驻洪江市带子街。
1950年3月20日，县人民政府迁至林城镇，辖7个区、1个县属镇，下设117个乡。
1950年12月，划出洪江镇，另立洪江市。
1951年7月，调整为8个区，辖117个乡和1个乡级镇。
1952年8月，会同专区改为芷江专区，1952年12月，芷江专区改为黔阳专区。
1954年至1955年调整为8个区，辖117个乡和1个城关镇。
1956年6月并为27个大乡和1个县辖镇，将沙溪区大桥乡划归靖县，靖县六黄溪乡划入会同县。
1958年9月，原28个乡镇合并，建立13个人民公社，并将大墓乡划归靖县。
次年12月，组成11个农村人民公社和1个城镇人民公社；1961年7月，设25个农村人民公社，1个镇人民公社；1962年6月，增设若水（辖8个公社）、朗江（辖5个公社）2区，1968年冬撤销。
1981年6月，黔阳地区改为怀化地区。
1984年4月，公社改乡，设25个乡、1个镇。
1985年4月，堡子乡和坪村乡改为堡子镇和坪村镇，设23个乡、3个镇。
1995年10月，团河、若水、朗江、广坪4乡改镇，设19个乡、7个镇。
1997年10月，撤销炮团、青朗、蒲稳、漠滨、宝田、金子岩6个乡，建立炮团侗族苗族、青朗侗族苗族、蒲稳侗族苗族、漠滨侗族苗族、宝田侗族苗族、金子岩侗族苗族6个民族乡，设13个乡、6个民族乡、7个镇。
1997年11月，怀化地区改为怀化市，属怀化市。
1999年12月，攀龙桥乡并入林城镇，设12个乡、6个民族乡、7个镇。
2002年9月将马鞍乡改置马鞍镇，设11个乡、6个民族乡、8个镇。