明朝属甘泉里。
清朝属郝枧铺。
民国初期沿袭清制，1921年隶属西乡，1936年隶属第三区，1947年属远北乡。
1950年3月为晒旗、九女、莲花自然村，属远北区。
1955年1月三个自然村属荷花区。
1956年夏成立晒旗、莲花、九女高级农业合作社，隶属青峰乡。
1959年4月改称晒旗、莲花、九女生产队，属青峰管理区。
1961年5月改称晒旗、莲花、九女生产大队，属青峰公社。
1975年2月三个大队改属望家公社。
1984年2月改称晒旗村、莲花村、九女村，同时分别成立晒旗村、莲花村、九女村村民委员会，属青峰乡。
1987年10月撤区并乡，属苟家垭镇。
2001年3月，苟家垭镇撤销，成立荷花镇，属荷花镇。
2002年10月，莲花村、九女村与晒旗村合并为晒旗村，属荷花镇。
2014年10月，荷花镇更名为嫘祖镇，属嫘祖镇至今。