清光绪七年至宣统三年（1881-1911年），本县共划分12甲69联保，五谷庙由大木团管辖；民国15年，本县划分为14个区，五谷庙归大木区管辖；民国20年，贺龙率红军三军到房县，开辟了以房县为中心的鄂西北革命根据地，建立县、区、乡苏维埃政权，五谷庙隶属大木区；民国23年，本县又并为5个区，五谷庙归五区大木厂乡管辖；民国24年，本县又恢复为8个区，五谷庙归八区大木长乡管辖；民国25年，废联保为乡，五谷庙归五区管辖；民国33年，将大木厂镇更名为大公镇；1949年8月，先后建立大木等区；1950年4月，本县划为大木等11个区，同年8月改大木为四区；1952年8月，全县划为1个镇，14个区，276个乡，五谷庙归四区管辖；1955年是大木区五谷乡辖区；1958年11月是大木公社五谷管理区的双丰大队、杨柳大队、五谷大队、黄粮大队、新塘大队；1961年为大木区五谷公社双丰大队、杨柳大队、五谷大队、黄粮大队、新塘大队；1975年3月为大木区大木公社双丰大队、杨柳大队、五谷大队、黄粮大队、新塘大队；1984年6月为大木区五谷庙乡马家台村、柳树垭村、五谷庙村、黄粮村、黄家营村；1987年11月为大木镇五谷庙办事处；1989年4为大木镇五谷庙管理区；1999年11月12日，黄粮与黄家营合并为黄家营村，马家台与柳树垭合并为马家台村，为大木镇五谷庙管理区黄家营村、马家台村、五谷庙村；2001年4月，合乡并镇；2002年小村并大村，原马家台村、黄家营村、五谷庙村合并为大木厂镇五谷庙村，下辖四个村民小组。