宋元明年间属汉阳县凤栖里，明代清初起属凤栖里戚家山村，清光绪二十五年（1899）属夏口厅凤栖里戚家山村，1912年属夏口县第五区，1929年复归汉阳县，195l年7月划入武汉市三家店区，1952年7月再归汉阳县，直至1958年10月，乡镇区划屡变，曾属长乐前乡、乐城乡、安乐乡、渡头乡、三店乡等。
1958年10月分属东西湖区三店、吴家山农场及区农科所。
辖区围垦建场前，仅吴家山北麓有几户人家。
1978年，建立吴家山新村街道办事处，辖区东起蔬四支沟（今四明路），西到蔬六支沟（今六顺路），北到今吴祁街，南至今五丰街综合市场，下置3个居委会。
1984年，改名吴家山街道办事处，辖区东起张公堤额头湾，西至蔬九支沟（今九通路）》，北抵三店农场杨木港村，南含吴家山农场长青村，下置7个社区。
从1990年代起逐步扩大为现域，下辖12个社区居民委员会，沿用至今。