清末，清水村隶南乡平水里。
宣统三年（1911）废里设区，清水村当时隶遵义县南四下区。
民国二十一年（1932）南四区改为第九区，清水村当时隶遵义县第九下区。
民国二十四年，清水村隶第九下区白果联保。
民国二十五年（1936），县区调整，第九上区、九下区与第六区合并成遵义县第五区，清水村当时隶第五区白果联保。
民国三十年（1941）清水村当时隶遵义县团溪区白果乡。
民国三十八年（1949）11月，设遵义县第四区（团溪），尚嵇镇隶第四区。
清水村当时隶遵义县第四区团溪区。
1950年6月，第十三区改为遵义县尚嵇区，清水村当时隶遵义县尚嵇区。
1951年，白果乡划回四区，清水村隶遵义县第四区白果乡。
1958年10月，尚嵇区改建为尚嵇基层人民公社，所辖清水乡改为清水大队。
1959年4月，清水大队改为清水管理区。
1984年5月，系尚嵇区清水乡。
1992年9月建镇并乡撤区，改建为尚嵇镇清水村，2003年12月撤销片区办事处，团山村、江林村合并为清水村。