汉元鼎六年（前111），属郁林郡。
西晋属晋兴郡。
隋属郁林郡。
唐属田州。
宋皇祐五年（1053）置勘羁縻州于今县境西南古美，先属右江道镇安军民宣抚司，后属广南西路邕州；又置奉议羁縻州于今县境东南右江东岸，属广南西路邕州。
南宋于今县北置上隆羁縻州，于今县城置来安军，均属邕州。
元至元十三年（1276），改来安军为来安路，领辖罗博、泗城、归乐、睢殿、路城、唐兴6土州，辖及今百色市之右江区、田阳、田林、凌云、乐业、隆林、西林等地；同期，废勘州，奉议、上隆2州改属田州路。
明洪武二年（1369），来安路改来安府，田州路改田州府，奉议、上隆2州属田州府；五年（1372），奉议州省入来安府；七年（1374），复置奉议州，直隶广西等处行中书省；十七年（1384），废来安府入田州府；二十八年（1395），奉议州改奉议卫。
明成化三年（1467），上隆州迁治今桂平市东北并更名武靖州。
成化六年（1470），奉议卫复改奉议州，直隶广西等处承宣布政使司。
嘉靖七年（1528），田州府降为田州，奉议州改隶思恩府。
清雍正七年（1729），奉议州改隶镇安府。
乾隆七年（1742）析田州土州置阳万土州判，治今百峰圩，属思恩府。
光绪元年（1875），田州之中田里划入奉议州判。
光绪五年（1879）奉议州判改奉议州，阳万土州判改恩阳土州判。
1912年改奉议州为奉议县，改恩阳土州判改流为恩阳县，均属百色府；1913年改属田南道；1927年奉仪县治迁到今田州镇，直隶广西省；1930年改属恩隆民团区；1932年改属百色民团区；1933年奉议县改属天保民团区。
并析老村、大位、大邦、马翁、果隆、山落、大问、大净、大将、咟贡、示洪、示下、秾洪、那当、那造、陇林16村，归天保县；1934年奉议县改属天保行政监督区，恩阳县改属百色行政监督区；1935年奉议、恩阳2县合为田阳县，治今那坡镇，属百色行政监督区；奉议、恩阳2县合并为田阳县，同时析出原属奉议县的仁安、慕桃、平马、檀河、作登、大榄、岜立、7乡归田东县，析出原属恩阳县的毕禄、平杨、楞安、温平、畔水5乡归百色县，析出德赖、扶隆、塘日、东凌4乡归敬德县。
1940年改属第十区行政督察区，1942年改属第六行政督察区；1944年改属第五行政督察区。
1949年属百色专区。
1952年原万冈县的鹅桥、凤桥、百羌3乡并入，改属桂西僮族自治区百色专区。
1953年原万冈县西南2乡并入。
1955年析出新层乡驮洪屯部分辖地划归田东县，划辖原德保县新美乡，迁治今田州镇。
1956年改属桂西僮族自治州百色地区。
1958年改属百色专区。
1971年改属百色地区。
2002年改属百色市。
2019年8月撤县设区。