民国二十二年（1933）设覃塘区，属贵县。
1950年为贵县第三区。
1955年复称覃塘区。
1958年改公社。
1984年改镇。
1988年属贵港市(县级)。
1996年设立覃塘管理区。
2003年3月析置覃塘区，辖覃塘、东龙、三里、黄练、石卡、五里6镇和古樟、振南、山北、蒙公、大岭5乡，属贵港市。
2004年11月，振南、古樟2乡合并为樟木乡。
截至2022年，覃塘区下辖1个街道，7个镇，2个乡，分别是覃塘街道，东龙镇，三里镇，黄练镇，石卡镇，五里镇，樟木镇，蒙公镇，山北乡，大岭乡。