1956年撤区并乡，成立六坝乡；1958年与城关镇和民联、南丰两乡合并建立东方红人民公社；同年山丹民乐两县合并，属民乐镇公社辖，1961年归属三堡公社管辖；1962年民乐、山丹分县后设六坝公社；1967年更名东风公社；1972年恢复六坝公社；1983年改为六坝乡至今。
2000年12月改设六坝镇人民政府。
2004年10月，原北部滩乡并入六坝镇人民政府。
因镇政府驻地六坝村而得名。
辖六坝、西上坝、六北、王官寨、六南、东上坝、四坝、海潮坝、五坝、韩武、四堡、铨将等。