石牌村位于寿山乡之东南部，古称石牌墩，东与溪下村相邻，南与宦溪镇峨嵋村交界，北与九峰村接壤。
宋嘉祐三年（1058年）怀安县知县樊纪曾在北峰地区的大北岭、小北岭修过古驿道，其中北驿道的一段从北门而出，经新店鹅峰，过红庙、江南竹、石牌，穿过石牌寺和林阳寺前，沿岭而下到桂湖和连江各地。
所以石牌村曾一度成为北峰的政治文化中心，曾成为石牌区公所所在地。
相传宋时，大理学家朱熹在贤场讲学时到过石牌寺，留有寺额“华峰”。
宋嘉定十三年（1220年），朱熹弟子黄勉斋先生在箕山之北创立高峰书院，这里一度成为中国儒学学子心中向往之地。
明清时，这里属候官县管辖，民国时，为闽侯县各第八区区公所在地，辖大小北岭地区（即北峰地区）。
中华人民共和国成立初，闽侯县小北岭区区公所扔设在石牌村的石牌境内。
1981年成立石牌大队，1986年建成石牌村委会。