明洪武八年(1375年),属溶溪芝麻子坪长官司。
清嘉靖二十九年(1550年),撤溶溪芝麻子坪长官司,直隶酉阳宣慰司。
清乾隆元年(1736年),秀山设县,溶溪从酉阳划出,隶属秀山县日旗里。
民国二十二年(1933年),属日旗里乡。
民国二十七年(1938年)5月,设为溶溪镇。
民国三十年(1941年),溶溪镇改为溶溪乡。
1958年9月,溶溪乡改为溶溪公社。
1983年11月,溶溪乡改为溶溪公社。
2001年7月,溶溪乡撤乡设镇,改为溶溪镇。