清朝时期（1644年-1911年），北石槽地区属顺义县正西路和西北路。
民国时期（1912年-1949年），北石槽地区属顺义县第六区。
1949年4月，北石槽地区属顺义县第十一区。
1950年，北石槽地区属顺义县第二区。
1956年8月，北石槽地区属东石槽乡。
1958年初，北石槽地区并入板桥乡；9月，为牛栏山人民公社下属管理区。
1961年，北石槽地区属板桥公社。
1975年8月，设北石槽人民公社。
1983年8月，北石槽公社改乡。
1994年5月，北石槽乡改镇。
1998年3月，顺义县改区，北石槽镇隶属顺义区并延续至今。